Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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