Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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