Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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NECTIN1Q15223 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NECTIN1Q15223 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NECTIN1Q15223 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NECTIN1Q15223 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NECTIN1Q15223 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NECTIN1Q15223 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
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