Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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BRD3Q15059 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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