Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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