Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CHD4Q14839 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CHD4Q14839 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CHD4Q14839 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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