Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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CKAP5Q14008 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CKAP5Q14008 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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