Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms