Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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