Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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