Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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