Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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