Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms