Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms