Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms