Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms