Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms