Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms