Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms