Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRX1P78414 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRX1P78414 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms