Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms