Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms