Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CABP4P57796 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CABP4P57796 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CABP4P57796 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms