Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB38P57729 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB38P57729 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms