Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S2P56377 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms