Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP9P55211 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms