Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms