Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms