Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP153P49790 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP153P49790 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP153P49790 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms