Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ME1P48163 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ME1P48163 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ME1P48163 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ME1P48163 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms