Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms