Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP5P45974 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP5P45974 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP5P45974 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP5P45974 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP5P45974 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms