Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms