Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRATP43155 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRATP43155 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms