Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGFBR1P36897 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms