Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms