Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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