Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms