Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA1P29973 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms