Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2E2P29084 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms