Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
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