Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD27P26842 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD27P26842 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD27P26842 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms