Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMO2P25791 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms