Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms