Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RAB5AP20339 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RAB5AP20339 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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