Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B1P20020 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms