Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XBP1P17861 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XBP1P17861 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
XBP1P17861 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
XBP1P17861 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms