Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFP17480 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFP17480 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBTFP17480 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBTFP17480 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBTFP17480 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBTFP17480 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFP17480 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFP17480 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFP17480 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms