Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODC1P11926 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODC1P11926 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms