Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3P10147 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms